| Lycée Jean Michel | Lycée Général & Technologique à Lons le Saunier | |
| Lycée Pierre Vernotte | Le lycée des arts du bois, du CAP au Diplôme des métiers d'art - Moirans | |
| Lycée Hyacinthe Friant | Lycée hotelier et polyvalent de Poligny | |
| Lycée Victor Bérard | Formations dans les domaines du génie otique, de la lunetterie, de la photonique et de la microtechnique | |
| Lycée professionnel Ferdinand Fillod | Métiers d'art et métiers industriels des métaux | |
| Centre scolaire Jeanne d'Arc | Etablissement d'enseignement privé, de l'école primaire au BTS | |
| Cité scolaire du Pré Saint-Sauveur | Collège et Lycée de Saint-Claude | |
| Enseignement Catholique Lédonien | Jeanne d’Arc – La Salle – Sainte marie | |
| Lycée professionnel Le Corbusier | Lycée professionnel du bâtiment à Lons-le-Saunier | |
| Lycée professionnel Montciel | Lycée professionnel à Lons-le-Saunier | |
| Lycée de Mancy | Lycée d'Enseignement général et technologique agricole à Lons-le-Saunier | |
| Cours Notre-Dame de l’Annonciation | Établissement scolaire privé du primaire au baccalauréat dans le château de Cressia | |
| Lycée Edgar Faure | Lycée d'Enseignement général et technologique agricole à Montmorot | |
| Lycée Charles Nodier | Lycée général Charles Nodier à Dole | |
| Lycée Jacques Duhamel | Lycée général, technologique et professionnel à Dole | |
| Lycée Paul-Émile Victor | Lycée polyvalent à Champagnole | |
| Groupe scolaire Mont Roland | Établissement scolaire privé à Dole, de la maternelle au bac+5 | |
| Cité Scolaire Victor Considerant | Lycée et collège de Salins-les-Bains |
